Das Arbeitsprogramm für den Bereich Sicherheitsforschung resultiert aus den Empfehlungen des Beratungsgremiums "European Security Research Advisory Board" (ESRAB) und den Erfahrungen aus den "Preparatory Actions for Security Research" (PASR), die im Zeitraum von 2004 bis 2006 als vorbereitende Maßnahmen durchgeführt wurden.

Die Arbeitsprogramme im Bereich Sicherheit sind in vier Missionen gegliedert, die als Reaktion auf spezifische Herausforderungen hoher politischer Relevanz und hinsichtlich des Mehrwertes für Europa in Bezug auf Bedrohungen und potenzielle sicherheitsrelevante Zwischenfälle bestimmt wurden:

• Sicherheit der Bürger
• Sicherheit von Infrastrukturen und Versorgung
• Intelligente Überwachung und Grenzsicherheit
• Wiederherstellung der allgemeinen und technischen Sicherheit in Krisensituationen

Die Arbeitsprogramme sind außerdem in drei Querschnittsaktivitäten unterteilt, an denen sich alle ausgeschriebenen Themen orientieren:

• Integration, Zusammenschaltung und Interoperabilität von Sicherheitssystemen
• Sicherheit und Gesellschaft
• Koordinierung und Strukturierung der Sicherheitsforschung